Test Covid-19 : PCR, salivaire, antigénique, où le faire ?

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"Test Covid-19 : PCR, salivaire, antigénique, où le faire ?"

Test PCR, antigénique, salivaire, autotest... Plusieurs tests de dépistage de la Covid-19 sont disponibles en France. Le prélèvement nasopharyngé par PCR (virologique) restant le plus fiable. Comment se faire tester ? Où ? En pharmacie ou au laboratoire ? Quand ? Combien de temps pour avoir les résultats ? Que faire quand le test est positif ? Marche à suivre.

[Mise à jour le jeudi 6 mai à 10h06] Le dépistage de la Covid est toujours un des piliers de la stratégie française pour lutter contre la propagation de l'épidémie. En un peu plus d'un an, la France a réalisé 76 millions de tests de dépistage de la Covid-19. La stratégie du gouvernement est double diagnostiquer la maladie Covid-19 via la réalisation des tests PCR (le plus fiable) et antigéniques (à réaliser dès les premiers jours de symptômes pour limiter les faux négatifs) pour savoir si, individuellement, les personnes sont porteuses ou non du virus Sars-CoV-2 (ou d'un de ses variants) et dépister en allant "chercher dans la population générale y compris chez des gens qui n'ont pas forcément de cas contact dans leur entourage s'ils sont positifs ou non au Covid" a expliqué le ministre de la Santé lors de la conférence du 22 avril. Pour cela, la France dispose de tests salivaires réalisés dans les écoles et des autotests. Depuis le 19 avril, le déploiement des certificats de tests positifs et négatifs est en place : le patient testé reçoit un SMS pour se connecter au portail SI-DEP et récupérer son certificat afin de l'importer dans TousAntiCovid-Carnet. Les certificats de tests pourront être utilisés dans le cadre de déplacement (voyage) comme "pass sanitaire". En cas de test positif à la Covid-19, un isolement de 10 jours est indiqué. Il fait systématiquement l'objet d'un criblage pour rechercher une contamination à un variant (variant anglais, sud-africain ou brésilien). Comment se faire tester ? Quand se faire tester ? Quand on est cas contact ? Combien ça coûte ? Faut-il une ordonnance ? Quel test pour voyager ? Est-ce gratuit ? Guide.

Combien de tests positifs en France ?

Au 29 avril, la France a réalisé 76 694 164 tests de dépistage du virus Sars-CoV-2 indique le site de données du gouvernement (RT-PCR et antigéniques). 5 490 768 se sont révélés positifs (7%). En semaine 16 (19-25 avril), le taux de dépistage était en diminution de -12% par rapport à la semaine précédente, selon Santé Publique France. Cette diminution concernait toutes les classes d'âge mais elle était plus marquée chez les 65-74 ans (-14%) suivis par les 45-64 ans et les 75 ans et plus (-12%), les 15-44 ans (-11%) et les 0-14 ans (-7%). Le taux de positivité (9,9%) était stable. Parmi les cas, 53% étaient symptomatiques, proportion stable par rapport à la semaine 15. Le nombre de cas était en diminution chez les symptomatiques (-12%) et chez les asymptomatiques (-10%)

Carte du taux de positivité des tests Covid-19 au 29 avril 2021

carte test covid france
Carte du taux de positivité des tests RT-PCR à la Covid-19 au 29 avril 2021 en France. © Gouvernement.fr

Depuis le 8 décembre, en plus des résultats des tests virologiques, ceux des tests antigéniques entrent dans la production des indicateurs épidémiologiques nationaux et territoriaux (taux d'incidence, taux de positivité et taux de dépistage). 

courbe personnes testées covid france
Nombre de personnes testées, nombre de personnes testées positives pour le SARS-CoV-2 et taux de positivité, par semaine, France (données au 28 avril 2021) © Santé Publique France

Quand se faire tester ?

Il faut se faire tester si on présente des symptômes évocateurs d'une infection Covid-19 ou si on est considéré comme un cas contact à risque. 

Cas contact

Pour l'ensemble des contacts à risque (foyer et hors foyer), un test antigénique doit être réalisé immédiatement, indique la DGS (sauf pour les enfants de moins de 6 ans, pas concernés par la mesure). Un deuxième test devra être réalisé à J+7 du dernier contact avec le cas confirmé et en l'absence de symptômes évocateurs de la Covid-19 ou à J+7 après la guérison du cas confirmé si la personne vit dans le même foyer. Les prélèvements naso-pharyngés peuvent être réalisés à partir de 6 ans sous réserve d'acceptabilité des parents. La durée de la quarantaine pour les contacts à risque reste à 7 jours après le dernier contact avec le cas confirmé ou probable. Un résultat négatif ne lève pas la mesure de quarantaine de la personne contact, il faut rester isolé 7 jours. 

→ A partir du 10 janvier, les cas-contact peuvent s'inscrire sur le site de l'assurance maladie pour obtenir un arrêt de travail immédiat, indemnisé et sans jour de carence.

Test chez les enfants

Le dépistage du coronavirus chez l'enfant revêt les mêmes conditions que chez l'adulte. Il peut être réalisé lors de symptômes évocateurs du Covid-19 ou si l'enfant est "cas contact" d'une personne récemment diagnostiquée positive (mais le test n'est pas obligatoire si l'enfant a moins de 6 ans). Les enfants peuvent être testés par PCR nasal (le plus fiable), via un test antigénique (nasal) et depuis le 11 février, à l'école, par tests salivaires. Ils pourront aussi être testés via autotests nasaux dans les établissements scolaires ou d'enseignement supérieur à partir du 26 avril (pour les plus de 15 ans).

Comment et où se faire dépister ?

Le dépistage du coronavirus peut se faire avec ou sans rendez-vous.

Profils Lieux de dépistage
Patient hospitalisé Hôpital
Patient ayant des symptômes évocateurs de la Covid-19  Laboratoire (RT-PCR) - Pharmacie (test antigénique)
Patient cas contact Covid Laboratoire (RT-PCR) - Pharmacie (test antigénique)
Patient asymptomatique Pharmacie (test antigénique, autotest) - Ecole (test salivaire ou autotest)

Comment trouver un laboratoire ?

La liste des centres de dépistages du Covid-19 est disponible sur Sante.fr ou sur le site du ministère de la Santé (cliquer sur "Sites de prélèvements"). Une fois que le lieu de dépistage est identifié, il faut appeler pour prendre rendez-vous. Si le laboratoire réalise le test sur place, il faut venir avec sa carte d'identité, carte Vitale et l'ordonnance si on en a une. Sans oublier de porter un  masque. De retour à la maison, il faut rester isolé en attendant les résultats. 

Dépistage de la Covid-19 en pharmacie

L'arrivée des tests antigéniques a permis d'ouvrir le dépistage de la Covid-19 aux pharmacies. Ce dépistage est au bon vouloir des pharmaciens, toutes ne le proposent pas, il n'y a aucune obligation. Les pharmaciens peuvent proposer des dépistages individuels ou participer à un dépistage organisé à large échelle (dans la ville, le département ou la région par exemple). En pharmacie, les prélèvements peuvent être effectués par les pharmaciens et les préparateurs en pharmacie et les étudiants ayant validé leur première année en pharmacie sous la responsabilité d'un pharmacien. L'analyse et le rendu du test sont uniquement permis au pharmacien. Les personnes symptomatiques et asymptomatiques peuvent être testés par test antigénique. Les pharmacies peuvent aussi réaliser des tests sérologiques (prélèvement de sang au bout du doigt).

→ Depuis le 7 février, la Direction générale de la Santé (DGS) a indiqué que tout test antigénique ou PCR, donnant lieu à un résultat positif doit obligatoirement faire l'objet d'une RT-PCR de criblage en seconde intention, réalisée dans un délai de 36 heures maximum, afin de déterminer s'il s'agit d'une contamination par un variant de la Covid anglais, sud-africain ou brésilien. Si la contamination est confirmée, le laboratoire ayant réalisé le test de première intention informe la personne contaminée qu'il s'agit d'une contamination par un variant dont la contagiosité est accrue. D

Quelle est la durée du test ?

Le test nasopharyngé ne prend que quelques secondes "avec un rendu de résultat, dans 90% des cas, dans les 24 heures qui suivent" a informé le ministre de la Santé Olivier Véran lors de la conférence de presse du jeudi 22 avril.

Faut-il avoir une ordonnance ?

Les tests PCR et antigéniques peuvent être réalisés sans ordonnance, que vous présentiez des symptômes ou non. Un test sérologique (dans le sang) peut aussi être effectué sans ordonnance mais ne répondra alors à aucune indication médicale, sa signification ne sera pas explicitée par un médecin et il ne sera pas remboursé par la Sécurité sociale. 

Les personnes avec ordonnance ou SMS de l'Assurance maladie (pour les cas contacts à risque) sont prioritaires pour la réalisation du test.

Délai de résultats 

Le résultat d'un test PCR est connu dans les 24 heures pour le patient (que le prélèvement soit nasopharyngé ou salivaire). Les tests antigéniques délivrent, eux, leurs résultats en 30 minutes. Même chose pour les autotests.

Test positif : que faire après ?

Dès lors que la personne a été testée positive, les cas contacts les plus à risque doivent être prévenus du risque de contamination et testés et s'isoler pour casser la chaîne de transmission du virus. Si vous êtes dépisté positif, vous recevrez un message sms de l'Assurance maladie renvoyant vers un site où vous êtes invité à préparer la liste de vos cas contact à risque ainsi que leurs coordonnées dans l'attente de l'appel téléphonique de l'Assurance maladie. La durée d'isolement des cas confirmés de SARS-CoV2 est harmonisée à 10 jours qu'il s'agisse du virus Sars-CoV-2 ou de ses variants britannique, sud-africain et brésilien.

L'isolement des cas positifs symptomatiques est de 10 jours pleins à partir de la date de début des symptômes avec absence de fièvre au 10ème jour (si le cas reste fébrile, l'isolement doit être maintenu pendant 48h après la disparition de cette fièvre).

Pour les cas confirmés asymptomatiques, l'isolement est compté à partir du jour du premier prélèvement positif (test antigénique ou RT-PCR de 1ère intention) pour une durée de 10 jours pleins également. En cas de survenue de symptômes évocateurs de la Covid-19, la période d'isolement devra être rallongée de 10 jours à partir de la date d'apparition des symptômes.

→ Si vous partagez votre logement, restez dans une pièce spécifique en évitant les contacts avec les autres personnes du domicile. Il ne faut pas toucher les objets touchés par les autres personnes, aérer votre domicile, porter en permanence un masque, les visites sont déconseillées.

→ Si les symptômes s'aggravent, n'attendez pas, appelez le médecin ou le 15.

→ La fin de l'isolement des cas symptomatiques et asymptomatiques n'est pas conditionnée à la réalisation d'un test de sortie d'isolement.

Test négatif

Même si le résultat du test est négatif, le patient ne doit avoir aucun contact avec des personnes fragiles pendant une semaine (personnes âgées de 65 ans et plus, porteuses d'une maladie chronique, avec obésité importante ou femme enceintes au 3e trimestre de grossesse). Il y aurait 20 à 30% de tests faussement négatifs c'est-à-dire une infection au COVID avec test nasopharyngé (PCR) négatif, quand le test est réalisé trop tôt ou trop tard. Il sort du domicile en portant systématiquement un masque. Les cas contacts à risque négatifs doivent s'isoler pendant 7 jours à partir du dernier contact avec le cas confirmé. 

Comment avoir son certificat de test ?

A compter du 19 avril, chaque Français a accès à ses certificats de tests RT-PCR et antigéniques négatifs et positifs qui peuvent être remis en main propre pour les versions papier par les personnels de santé ainsi que les laboratoires, ou disponibles en numérique sur la plateforme dédiée si-dep (le patient testé reçoit un SMS pour se connecter au portail SI-DEP et récupérer son certificat afin de l'importer dans TousAntiCovid Carnet).

Quels sont les différents types de tests Covid ?

Face à la sévérité de la pandémie de coronavirus, les laboratoires et les instituts de recherches ont développé des solutions de diagnostique permettant de détecter le virus SARS-Cov-2, responsable de la maladie Covid-19. Il faut distinguer la technique de prélèvement (nasale, salivaire...) de la technique d'analyse (RT-PCR, antigénique...). Parmi les solutions proposées :

Test virologique ou PCR

Le test diagnostique dit "virologique" ou "PCR" ("polymerase chain reaction") est le test de référence en France pour dépister le coronavirus, depuis le début de l'épidémie. Il permet de faire le diagnostic précoce de l'infection via un prélèvement naso-pharyngé (gorge, nez, nasopharynx) qui se fait à l'aide d'un petit écouvillon (goupillon) inséré dans le nez. Il s'agit d'un test facile à effectuer, non invasif mais désagréable pour le patient car un peu douloureux. Il est effectué par un médecin, biologiste ou une infirmière. L'échantillon est analysé par un laboratoire spécialisé afin de rechercher la présence du matériel génétique du coronavirus et ainsi confirmer le diagnostic de l'infection. En temps normal, le laboratoire a connaissance du résultat en 3 heures. 

Test antigénique

test antigénique covid
Test antigénique © SYSPEO/SIPA

Les tests antigéniques sont autorisés en France dans le dépistage de l'infection Covid-19 depuis l'arrêté paru au Journal Officiel le 16 septembre 2020. Il s'agit de tests rapides (résultats en 30 minutes) validés plus tôt que prévu pour "décharger les laboratoires de biologie médicale de certaines patientèles et améliorer les délais de transmission des résultats des tests RT-PCR" indique le texte. La Haute Autorité de Santé a donné son feu vert, le 25 septembre, à leur déploiement. Le 10 novembre, un communiqué du site Service-public.fr confirmait leur disponibilité dans les pharmacies et les aéroports en France. Ils ne pouvaient jusqu'alors être pratiqués que par les médecins et les infirmiers diplômés d'État en cabinet ou au domicile du patient. Ces tests recherchent non pas le matériel génétique du virus, mais une protéine présente dans le virus. Ils répondent à la question "Le patient est-il oui ou non atteint du COVID-19 ?".

Test salivaire

Les tests salivaires analysés par RT-PCR sont validés par la Haute Autorité de Santé le 11 février 2021. Ils peuvent être réalisés en première intention dans le cadre d'un dépistage à large échelle sur une population fermée asymptomatique (écoles, collèges, lycées, universités ou personnels d'établissement de santé ou d'Ehpad…) et en seconde intention chez les patients symptomatiques et cas-contacts lorsque le prélèvement nasopharyngé est difficile ou impossible. L'analyse salivaire recherche le génome du virus SARS-CoV-2. Elle est un peu moins efficace que le test PCR nasopharyngé mais présente l'avantage d'être mieux accepté et toléré par les enfants et les personnes qui doivent se tester régulièrement. Pour l'instant, les tests rapides type EasyCoV® n'ont pas reçu le feu vert des autorités sanitaires pour un déploiement grand public (leur technique d'analyse diffère et se fait par RT-Lamp, ils sont réservés aux cas symptomatiques).

Test sérologique à la recherche des anticorps (sang)

La sérologie peut être réalisée au moyen de tests automatisables (de type enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) par exemple) ou de tests rapides. Les tests sérologiques automatisés de type ELISA et les tests sérologiques unitaires rapides recherchent des anticorps liés au coronavirus dans le sang qui peuvent déterminer si une personne a déjà été infectée par le coronavirus. Par la détection des anticorps (IgG notamment), ces tests permettent de confirmer une infection passée, ces anticorps apparaissant au cours de l'infection (détection possible dès le 6e jour de la maladie, mais parfois qu'après le 28e jour chez les patients ayant des formes cliniques frustres) et se renforçant au cours de la convalescence. Les tests sérologiques ne permettent pas d'indiquer si l'infection est en cours et si le sujet est contagieux ou si une immunité protectrice est acquise" Un test sérologique positif ne doit pas changer votre comportement, vous pouvez encore contaminer une personne, la distanciation sociale s'applique à tous, que le test sérologique soit positif ou négatif. La sérologie ne remplace pas le test PCR" précisait Olivier Véran le 28 mai.

Test rapide : TDR, TROD

Les tests rapides de dépistage de la Covid-19 sont aussi appelés "TDR" (Test de Diagnostic Rapide), TROD (Test Rapide d'Orientation Diagnostique) et autotests. Les TDR et TROD sont des tests pour lesquels le prélèvement, la réalisation et l'interprétation sont effectués par un professionnel de santé ou par du personnel ayant reçu une formation adaptée et relevant de structures de prévention et associatives. Ces tests ont une sensibilité moindre que le test RT-PCR nasopharyngé. En France, les tests rapides autorisés sont :  

  • Les tests rapides sérologiques recherchant la présence d'anticorps du virus, dans le sang (signe d'une contamination passée) autorisés par un arrêté du 11 juillet 2020 et qui peuvent être réalisés en pharmacie.
  • Les tests rapides antigéniques sur prélèvement nasopharyngé autorisés en septembre 2020.
  • Les tests rapides antigéniques sur prélèvement nasal (moins profonds) autorisés en mars 2021. Ces tests sont autorisés sans limite d'âge depuis le 26 avril 2021 par la HAS.

Autotests de dépistage du Covid-19

Les autotests de dépistage du coronavirus font partie des tests rapides qui délivrent leurs résultats en quelques minutes. Ils sont autorisés par la HAS le 16 mars 2021 via prélèvement nasal, et sans limite d'âge depuis le 26 avril. Ils sont disponibles en pharmacie depuis le 12 avril. Ils peuvent être utilisés dans les écoles pour des dépistages préventifs chez des élèves asymptomatiques ainsi que dans la sphère privée en complément des tests déjà disponibles (par exemple, avant une rencontre avec des proches ou dans le cadre d'accès à des activités en espace clos : restauration, cinéma, spectacles vivants, etc.). L'autotest doit idéalement être réalisé le jour même ou à défaut la veille de la rencontre/activités.

Quel est le prix des tests ? Est-ce gratuit ?

Faire un test de dépistage au coronavirus est gratuit pour le patient puisque 100% pris en charge par l'Assurance maladie, sans avance de frais. Seuls les autotests en libre accès pour la population générale ne sont pas remboursés (excepté pour les aides à domicile auprès de personnes âgées et handicapées et les accueillants familiaux).

  • Le coût du test de dépistage du coronavirus par PCR est de 54 euros. 
  • Pour les tests sérologiques et rapides (antigéniques), les prix de référence fixés pour le remboursement de l'acte sont de 12,15 euros pour un test ELISA et de 9,45 euros pour un test de diagnostic rapide
prix test pcr covid
Comparatif du coût des tests PCR Covid dans quelques pays européens. © Twitter-Jean Castex-04 février 2021

Faut-il faire un test avant de voyager ?

Avec la diffusion des variants de la Covid-19 depuis le début de l'année 2021, les conditions de voyage se sont durcies et l'idée du pass sanitaire se développe en Europe et notamment en France. Depuis le 19 avril, des certificats de tests positifs et négatifs sont envoyés à la personne qui se fait tester : le patient testé reçoit un SMS pour se connecter au portail SI-DEP et récupérer son certificat afin de l'importer dans l'application TousAntiCovid-Carnet. Et depuis le 29 avril se déploient les certificats de vaccination : le patient peut récupérer son attestation de vaccination après l'acte de vaccination afin de l'importer aussi dans TousAntiCovid-Carnet.

DATES CLES DU DEPISTAGE DU COVID-19 EN FRANCE
  • Janvier 2020 : "Les premiers tests ont été distribués fin janvier-début février 2020 aux hôpitaux" informait le Pr Arnaud Fontanet, membre du Comité scientifique Covid-19 le 20 avril 2020. Seuls les personnes présentant des symptômes d'atteintes respiratoires (toux, fièvre, essoufflement) et ayant eu un contact avec la Chine ou avec une personne revenant de Chine sont testés. 
  • 14 mars : la France passe au stade 3 de l'épidémie, seules les personnes à risque sont testées (soignants...).
  • 6 avril : Le dépistage prioritaire est étendu aux résidents des Ehpad et aux personnels qui les accompagnent.
  • 11 mai : lors du déconfinement, tous les Français qui présentent des symptômes évocateurs du Covid-19 peuvent se faire tester. 
  • 25 juillet : les tests peuvent être réalisés sans présenter de symptômes et sans ordonnance.
  • Septembre : face à l'afflux de patients, une priorisation des publics est instaurée pour la réalisation des tests. Les personnes avec ordonnance et symptômes sont prioritaires ainsi que les cas contacts "à risque".
  • Novembre : les tests rapides antigéniques sont déployés dans les pharmacies et aéroports en France pour renforcer et accélérer le dépistage des cas Covid-19.
  • 11 février 2021 : autorisation des tests salivaires par RT-PCR en première intention dans les écoles, universités, Ehpad...
  • 16 mars 2021 : Autorisation des tests rapides nasaux pour dépister la Covid-19 chez les plus de 15 ans (TDR, TROD et autotests). 
  • 12 avril : arrivée des autotests dans les pharmacies françaises.
  • 19 avril :  Déploiement des certificats de tests positifs et négatifs : le patient testé reçoit un SMS pour se connecter au portail SI-DEP et récupérer son certificat afin de l'importer dans TousAntiCovid Carnet
  • 26 avril : déploiement des autotests dans les établissements scolaires ou d'enseignement supérieur.

Sources :

COVID-19 : Santé publique France adapte ses indicateurs pour surveiller au plus près l'épidémie. Communiqué de presse. 8 décembre 2020.

COVID-19 : les tests antigéniques sont performants chez les patients symptomatiques. Haute Autorité de Santé. Communiqué de presse. 25 septembre 2020.

• Avis n°8 du Conseil scientifique COVID-19 27 juillet 2020 Se préparer maintenant pour anticiper un retour du virus à l'automne. 27 juillet 2020.

Sérologie : les réponses à vos questions, 29 mai 2020.

Place des tests sérologiques rapides (TDR, TROD, autotests) dans la stratégie de prise en charge de la maladie COVID19. HAS. 14 mai 2020.

Avis du Conseil scientifique COVID-19 2 avril 2020 Etat des lieux du confinement et critères de sortie.

Publication de l'Institut Pasteur, résultats de tests sérologiques, 23 avril 2020.

Information du Gouvernement, Tests et dépistage, 10 mai 2020.

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