Variants Covid : en 2026, nouveaux, majoritaires en France

La souche initiale du Sars-CoV-2 apparue fin 2019 et s'est répandue dans le monde et continue d'évoluer. Après les variants Alpha, Delta... c'est Omicron et ses descendants qui se sont imposés dans le monde depuis fin 2021. De nombreux sous-lignages d'Omicron se sont depuis succédé (XBB, BA.2.86, JN.1...). 

C'est quoi un variant ?

Tous les virus, y compris le Sars-CoV-2, évoluent au fil du temps et mutent. Le potentiel de mutation des virus augmente avec la fréquence des infections (humaines et animales). La plupart des mutations passent inaperçues et ne modifient en rien les effets du virus. Il peut même être moins contagieux. L'émergence de nouvelles variantes des virus n'est donc pas inattendue des scientifiques mais elles inquiètent dès lors qu'elles confèrent au virus une augmentation de sa transmissibilité ou une capacité à échapper à la réponse immunitaire de l'hôte. Ces nouvelles souches ou "variantes" sont alors analysées et suivies de près. 

Quels variants circulent en 2026 ?

En septembre 2026, les variants du SARS-CoV-2 qui circulent restent issus de la famille Omicron. Au niveau mondial, l'OMS suit notamment JN.1 comme variant d'intérêt (VOI) ainsi que XFG, NB.1.8.1, PQ.16.1.1 et BA.3.2 comme variants sous surveillance (VUM). XFG est devenu le variant le plus fréquemment détecté à l'échelle mondiale parmi les séquences disponibles. Aucun variant actuellement en circulation ne présente, selon les données disponibles, de risque supplémentaire pour la santé publique par rapport aux autres variants circulants. En Europe, aucun variant ne remplit actuellement les critères de "variant préoccupant" de l'ECDC.

Quel est le variant majoritaire en France en ce moment ?

Les données françaises montrent que plusieurs descendants d'Omicron ont circulé en France en 2026. En mars 2026, dernière période détaillée dans les données de surveillance de Santé publique France, BA.3.2 et ses sous-lignages représentaient 37,9 % des séquences détectées en France. XFG et ses sous-lignages représentaient également 37,9 %, et NB.1.8.1 et ses sous-lignages 19 %. Le lignage individuel le plus fréquemment détecté était RE.2.2 avec 32,8 % des séquences, devant XFG.14 (17,2 %). En Europe, l'ECDC indique que XFG est dominant au 28 août 2026.

Quel est le variant majoritaire dans le monde ?

XFG est actuellement le variant Omicron le plus fréquemment détecté au niveau mondial. Selon les données de l'OMS, XFG représenterait 41 % des séquences transmises durant la semaine se terminant le 16 août 2026, contre 28 % quatre semaines auparavant. L'OMS souligne que la surveillance du SARS-CoV-2 est aujourd'hui beaucoup moins importante et moins représentative qu'au début de la pandémie. Ces proportions doivent donc être interprétées avec prudence.

Quelle est la liste des variants du Covid ?

En septembre 2026, l'OMS distingue notamment les variants d'intérêt (VOI) et les variants sous surveillance (VUM).

► Variant d'intérêt (VOI) : JN.1

► Variants sous surveillance (VUM) :

• XFG
• NB.1.8.1
• PQ.16.1.1
• BA.3.2

Définition et classement des variants VOC, VOI, VUM

Les critères selon lesquels un variant est classé par l'OMS comme VUM, VOI ou VOC sont :

► VUM = variant en cours d'investigation/sous surveillance (variant under monitoring) : modifications génétiques avec effet possible sur ses caractéristiques ET signaux précoce d'un avantage de croissance MAIS incertitudes quant à son impact épidémiologique et clinique

► VOI : variant à suivre (variant of interest) : modifications génétiques avec effet possible ou démontré sur ses caractéristiques ET avantage de croissance dans plus d'une région OMS associée à une augmentation du nombre de cas, ou autre signal épidémiologique suggérant un risque accru pour la santé publique

► VOC : variant préoccupant (variant of concern) : variant répondant à la définition d'un VOI ET sévérité accrue OU diminution importante de l'efficacité vaccinale contre les formes sévères OU modification de caractéristiques pouvant affecter la capacité des structures de soin à prendre en charge les patients COVID-19.

Comment sont donnés les noms des variants du Covid ?

Le 31 mai 2021, l'OMS a décidé de renommer les variants principaux de Covid avec des lettres grecques (c'est-à-dire Alpha, Beta, Gamma...) afin de faciliter leur prononciation, de les retenir plus facilement et d'éviter aussi leur association "stigmatisation et discriminatoire" avec les pays où ils ont émergé (comme on a appelé le variant "anglais", le variant "indien"...), a expliqué l'autorité dans un communiqué. Ces nouveaux noms ne remplaceront pas les noms scientifiques existants (par exemple ceux attribués par GISAID, Nextstrain et Pango), qui véhiculent des informations scientifiques importantes et continueront à être utilisés dans la recherche (comme B.1.1.7 pour le variant dit "anglais"). L'alphabet grec compte 24 lettres.

► Liste complète des noms de tous les variants du Covid

Quelle est la contagiosité des variants du Covid ?

"Les sous-lignages du variant Omicron circulants restent caractérisés par des formes cliniques moins sévères, mais cette moindre sévérité est en partie liée à une efficacité vaccinale conservée contre les formes graves" précise Santé Publique France.