Variant BA5 Covid : symptômes, contagion, immunité

Le virus initial de la maladie Covid-19, le Sars-Cov-2, a muté plusieurs fois. Le variant Omicron est arrivé fin 2021 en France. Ce variant a plusieurs sous-lignages dont le BA.5 qui était majoritaire en France en 2022 mais a commencé à diminuer en janvier 2023. Il n'est plus majoritaire (12% des séquences analysées) selon les chiffres publiés par Santé Publique France le 5 avril. Le lignage BA.5 est remplacé par le XBB (également dérivé d'Omicron). Parmi les sous-lignages les plus détectés de BA.5, le BQ.1.1 diminue aussi.

C'est quoi le variant BA.5 ?

BA.5 est un sous-lignage du variant Omicron du Covid-19, majoritaire depuis le début de l'année 2022. Il a commencé à être identifié en janvier et février 2022 en Afrique du Sud selon l'ECDC ; début avril selon Santé publique France. Il s'est diffusé au Portugal, entraînant une nouvelle vague de Covid-19 en mai 2022 particulièrement virulente pour les plus de 80 ans. Il a été rapidement surveillé à cause de sa mutation L452 (comme le BA.4) associée à une transmissibilité accrue.

Quels sont les symptômes du variant BA.5 ?

Selon Santé Publique France, les signes cliniques les plus fréquents en cas d'infection aux variants BA.4 et BA.5 sont la fatigue, la toux, la fièvre et les maux de tête. De plus, "la probabilité de présenter anosmie [perte d'odorat] et agueusie [perte du goût], mais aussi nausées, vomissements et diarrhée est plus élevée pour les cas de BA.4/BA.5" indique l'agence de santé. "Au lieu de durer en moyenne 4 jours, ils durent plutôt 7 jours voire 10 jours donc on contamine plus longtemps" a expliqué le Dr Damien Mascret le 27 juin 2022. Un nouveau symptôme est rapporté par le Professeur Luke O'Neill du Trinity College de Dublin (Irlande) : les sueurs nocturnes : "La maladie est différente parce que le virus a changé, les sueurs nocturnes étant un nouveau symptôme" a déclaré l'immunologiste à la radio irlandaise Newstalk le 7 juillet.

 Combien de temps durent les symptômes du variant BA5 ?

La durée des signes cliniques est en moyenne de 7 jours pour les cas de BA.4 et BA.5 contre 4 jours pour les autres cas Omicron.

Quelle est la durée d'incubation du variant BA5 ?

Il n'y a pas de données précises sur le temps d'incubation du variant BA5 d'Omicron. En revanche, on sait que la durée d'incubation du variant Omicron est plus courte que celles des précédents variants du Covid soit 3 jours contre 5 jours avant.

Les vaccins sont-ils efficaces contre le variant BA.5 ?

Pendant la période de prédominance des sous-variants Omicron BA.4 et BA.5, les doses de rappel des vaccins monovalents sont restés efficaces pour protéger contre le risque d'hospitalisation pour Covid-19. Cette protection diminue dans le temps mais l'efficacité est d'autant plus importante que le nombre de doses reçues est élevé ou que la dernière dose est rapprochée de la précédente.

► Comparée à l'absence de vaccination, les doses de rappel sont efficaces à 56% pour la 3ème dose et à 75% pour les 4ème et 5ème doses sur le risque d'hospitalisation. Cette efficacité atteint 82% quelle que soit la dose de rappel reçue jusqu'à 2 mois après l'injection mais diminue à plus de 9 mois à 52%.

► Comparée à la primo-vaccination, l'efficacité d'une dose de rappel sur le risque d'hospitalisation est estimée à 69% jusqu'à 2 mois après l'injection et diminue ensuite avec le temps pour 55% d'efficacité à 4 mois de l'injection, à 30% à 6 mois puis à 22% pour 6 mois et plus. 

Depuis l'autorisation du 20 septembre 2022 de la HAS, la campagne de rappel ciblant les sous-lignages BA.5 et BA.5 utilisent les vaccins bivalents de Pfizer, Moderna, Sanofi et Novavax (qui cible la souche originale du Sars-Cov-2 et les sous-lignages Omicron) c'est-à-dire un vaccin adapté aux souches circulantes, un peu comme le vaccin contre la grippe qui change chaque année. "Les vaccins bivalents sont mieux adaptés aux variants circulants, et peuvent contribuer à l'efficacité vaccinale contre l'infection. Une troisième dose avec un vaccin monovalent augmente fortement la neutralisation de l'ensemble des principaux sous-lignage Omicron. Mais cette augmentation est encore plus importante chez les personnes vaccinées puis infectées par un sous-lignage d'Omicron. Enfin, une étude chez la souris a montré que les vaccins bivalents amélioraient la production d'anticorps neutralisants efficaces contre BA.5" indique Santé Publique France dans sa dernière analyse de risque des variants du 5 octobre. Concernant les personnes de moins de 30 ans, la HAS maintient sa recommandation de n'utiliser que le vaccin Comirnaty® (Pfizer BioNTech). 

Le variant BA.5 est-il plus contagieux ?

"Le BA5 est plus contagieux que le BA2. Compte tenu du fait qu'il est plus contagieux, il échappe un peu mieux à l'immunité post-vaccinal", a expliqué Yves Buisson, président de la cellule Covid de l'Académie de Médecine sur Europe le 7 juin 2022. Les symptômes durent plus longtemps (7-10 jours) "donc on contamine plus longtemps" a expliqué le Dr Damien Mascret le 27 juin.

Le variant BA.5 est-il plus dangereux ?

Les données accumulées dans plusieurs pays n'ont pas observé d'augmentation de la sévérité associée à BA.4 et BA.5.

Quels traitements sont efficaces si on est contaminé par le variant BA.5 ?

Le Paxlovid reste le traitement curatif de première intention quel que soit le variant ou sous-variant de SARS-CoV2. "Son activité n'est pas modifiée vis-à-vis de BA.4 et BA.5 par rapport aux sous-variants BA.1 et BA.2" confirme la Direction générale de la santé le 11 juillet. Cet antiviral est administré par voie orale. Il peut être prescrit par tout médecin, et est disponible dans les établissements de santé et dans les pharmacies d'officine depuis le 2 février 2022. 

Sources :

- Analyse de risque sur les variants émergents du SARS-CoV-2 réalisée conjointement par Santé publique France et le CNR des virus des infections respiratoires

- Mise à jour épidémiologique : SARS-CoV-2 Omicron sous-lignées BA.4 et BA.5, ECDC, 13 mai 2022

- Bulletin épidémiologique, Santé Publique France

- Kislaya I, Casaca P, Borges V, Sousa C, Ferreira BI, Fernandes E, et al. SARS-CoV-2 BA.5 vaccine breakthrough risk and severity compared with BA.2: a case-case and cohort study using Electronic Health Records in Portugal. medRxiv. 2022:2022.07.25.22277996.