Variant californien du Covid : cas en Alsace, plus mortel ?

Après les variants anglais, brésilien et sud-africain, une nouvelle mutation de la Covid-19 a été détectée en France, plus précisément en Alsace. Il s'agit d'un variant provenant du sud de la Californie. Ce variant californien est-il plus dangereux ? Plus mortel ? Où est-il présent pour le moment ? Etat des lieux à date.

Variant californien du Covid : cas en Alsace, plus mortel ?
© Iuliia Safronova - 123RF

Un nouveau variant de la Covid-19 aurait été pour la première fois détecté aux Etats-Unis, plus précisément en Californie du Sud. Depuis le mois de janvier, ce variant californien se serait répandu dans de nombreux états américains. Mais aussi en France. En Alsace, dans le Grand Est, plusieurs personnes auraient été contaminées par cette nouvelle souche de la Covid-19. Que sait-on du variant californien ? Est-il plus mortel que les autres variants ? Y a-t-il eu d'autres cas en France ?  Etat des lieux à date. 

Définition, nom : qu'est-ce que le variant californien ?

Le virus SRAS-CoV-2, responsable de la pandémie Covid-19, ne cesse d'évoluer et mute régulièrement. C'est un virus à ARN qui, pour survivre, doit se répliquer. Après la détection des variants anglais, sud-africain, brésilien, une nouvelle variante du SRAS-CoV-2 a émergé dans le sud de la Californie. Le nom de variant californien est le CAL.20C. Selon une étude menée par des chercheurs américains (notamment des médecins du Centre médical Cedars-Sinaï, un grand hôpital de Los Angeles) et publiée le 11 février 2021 sur la plateforme scientifique Jama Network, le variant californien est définie par trois mutations dans la protéine Spike, la "clé" qui permet au virus de pénétrer dans nos cellules et contre laquelle les vaccins sont dirigés.

Le variant californien en France : où est-il présent ?

En Alsace (Saverne)

Le variant californien serait présent en Alsace depuis le mois de janvier 2021, soit un peu avant le variant anglais ou le variant sud-africain, rapporte les Dernières Nouvelles d'Alsace le 17 février. En effet, 180 séquençages du Sars-CoV-2, dont 60 provenaient de patients hospitalisés pour la Covid-19, ont été réalisés au sein des Hôpitaux Universitaires de Strasbourg entre le 18 janvier et le 9 février 2021. Le séquençage est un procédé permettant de déterminer l'ordre des acides aminés d'une protéine ou des bases dans les acides nucléiques (ADN ou ARN). "Cela permet de connaître au jour le jour la part de variants dans l'épidémie", précise Olivier Véran, ministre de la Santé, lors d'une conférence de presse le 18 février. Parmi les patients atteints de la Covid-19, plus de 70% avaient dans leur organisme un variant inconnu (ni anglais, ni sud-africain, ni brésilien). 6 d'entre eux présentaient une trace du variant californien. En analysant les génomes de ces patients, il a été prouvé que le variant californien était apparu au sein d'un cluster à Saverne, une commune du Bas-Rhin.  

Le variant californien aux Etats-Unis : origine, nombre de cas ?

Les chercheurs de cette étude américaine ont analysé plus de 10 000 échantillons de Californie, dont la moitié provenait du sud de la Californie. Au terme de leurs analyses, ils ont pu montrer que :

  • En juillet 2020, le variant californien a été observé pour la première dans l'un des 1 247 échantillons du comté de Los Angeles.
  • De juillet à octobre 2020, le variant californien n'a pas été détecté dans le sud de la Californie.
  • Dès octobre 2020, la prévalence du variant californien a augmenté dans l'État de Californie et dans le sud de la Californie.
  • En novembre 2020, 30 cas du variant californien ont été identifiés en Californie du Nord et des cas individuels dans 5 États américains supplémentaires.
  • Au 22 janvier 2021, le variant californien représentait 44% de tous les échantillons collectés en janvier en Californie du Sud et a été détecté dans 26 états et/ou autres pays

Est-il plus mortel ?

"Ils se transmettent très facilement, mais ne sont pas forcément préoccupants"

Les résultats cliniques de cette nouvelle souche n'ayant pas encore été établis, la contagiosité et la dangerosité du variant californien reste incertaines. Toutefois, les chercheurs de Los Angeles indiquent que ce nouveau variant pourrait être résistant aux vaccins actuellement disponibles aux Etats-Unis. "Il ne faut pas s'en inquiéter, mais simplement les considérer comme d'autres déclinaisons du Sars-CoV-2. Ils se transmettent très facilement, mais ne sont pas forcément préoccupants" tient à préciser la Professeure Samira Fafi-Kremer, responsable du laboratoire de virologie des Hôpitaux Universitaires de Strasbourg au Figaro. "Ce variant ne présente pas d'inquiétude particulière", confie-t-elle au Figaro.

Fusion du variant anglais et du variant californien : quel risque ?

Les variants britannique (B.1.1.7) et californien (B.1.429) auraient fusionné et combiné leurs génomes pour donner naissance à un variant-hybride, qui pourraient présenter les mêmes caractéristiques que ses deux "parents", rapporte un article du New Scientist du 16 février 2021. Cette "recombinaison" aurait été détectée par Bette Korber, un chercheur du Los Alamos National Laboratory (Nouveau-Mexique) dans un échantillon de virus en Californie. Les scientifiques le savent : le SARS-CoV-2 a la capacité de muter régulièrement. Mais, jusqu'à présent, ces mutations se faisaient à l'intérieur du génome d'un seul virus, avec des petits changements dans le code génétique qui s'effectuaient seulement l'un à la fois. Donc si cette découverte est confirmée, il s'agirait du premier virus "recombinant" a être détecté depuis le début de la pandémie. La sphère scientifique surveille de près cette recombinaison, dont on ignore pour le moment sa contagiosité ou sa dangerosité. 

Source : Emergence of a Novel SARS-CoV-2 Variant in Southern California, 11 février 2021, JAMA NETWORK. 

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