Test Covid-19 : PCR, salivaire, antigénique, prix, en pharmacie ?

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"Test Covid-19 : PCR, salivaire, antigénique, prix, en pharmacie ?"

Le test de référence pour dépister la Covid-19 se fait par RT-PCR dans le nez. Il y a aussi les tests rapides antigéniques désormais autorisés aux personnes contacts et les test salivaires (EasyCov) que valide la Haute Autorité de Santé le 28 novembre. Où se faire tester ? Est-ce gratuit ? Quels tests avec ou sans symptômes ? Guide.

[Mise à jour le lundi 30 novembre à 12h44] La deuxième vague de l'épidémie de coronavirus en France redescend. Le nombre de personnes testées positives diminue, il est de 11% selon les dernières données du site du gouvernement. Parallèlement, les capacités de dépistage ont augmenté depuis le début du mois de novembre avec le déploiement des tests antigéniques. Dans un communiqué du 28 novembre, la Haute Autorité de Santé (HAS) se prononce en faveur de leur utilisation pour les personnes contact, ce qui n'était pas possible jusqu'ici. Elle se montre aussi favorable à l'utilisation et au remboursement de tests salivaires dits "intégrés" (nommé EasyCov) chez les personnes symptomatiques du Covid-19 et pour lesquelles le prélèvement nasopharyngé est impossible ou difficilement réalisable. Où se faire tester ? Quand ? Faut-il être prioritaire ? Quel test avant de quitter la France ? Quel formulaire faut-il remplir avant de venir au laboratoire ? Est-ce gratuit ? Comment se passe le test ? Faut-il une ordonnance ? Guide.

Nombre de tests par jour en France : à combien est-on ?

La France réalise près de 2 millions de test par semaine soit un peu plus de 285 000 par jour. Sur les 7 derniers jours, 13,34% des tests Covid-19 réalisés en France se sont révélés positifs indique le site de données du gouvernement au 22 novembre. Depuis le 25 juillet, tout Français peut se faire tester, même s'il n'a pas de symptômes, ni d'ordonnance. 

Liste des tests validés en France

Tous les tests de dépistage du coronavirus validés en France sont indiqués sur le site du ministère de la Santé. Parmi eux : 116 tests sérologiques et 58 tests RT-PCR validés par le CNR (Centre national de référence), 68 tests antigéniques (validés par la Haute Autorité de Santé).

Types de tests de détection du coronavirus

Face à la sévérité de la pandémie de coronavirus, les laboratoires et les instituts de recherches ont développé des solutions de diagnostique permettant de détecter le virus SARS-Cov-2, responsable de la maladie Covid-19. Parmi les solutions proposées :

Test virologique ou PCR (nez)

Le test diagnostique dit "virologique" ou "PCR" ("polymerase chain reaction") est le test de référence en France pour dépister le coronavirus, depuis le début de l'épidémie. Il permet de faire le diagnostic précoce de l'infection via un prélèvement naso-pharyngé (gorge, nez, nasopharynx) qui se fait à l'aide d'un petit écouvillon (goupillon) inséré dans le nez. Il s'agit d'un test facile à effectuer, non invasif mais désagréable pour le patient car un peu douloureux. Il est effectué par un médecin, biologiste ou une infirmière. L'échantillon est analysé par un laboratoire spécialisé afin de rechercher la présence du matériel génétique du coronavirus et ainsi confirmer le diagnostic de l'infection. En temps normal, le laboratoire a connaissance du résultat en 3 heures. 

Test sérologique à la recherche des anticorps (sang)

La sérologie peut être réalisée au moyen de tests automatisables (de type enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) par exemple) ou de tests rapides. Les tests sérologiques automatisés de type ELISA et les tests sérologiques unitaires rapides recherchent des anticorps liés au coronavirus dans le sang qui peuvent déterminer si une personne a déjà été infectée par le coronavirus. Par la détection des anticorps (IgG notamment), ces tests permettent de confirmer une infection passée, ces anticorps apparaissant au cours de l'infection (détection possible dès le 6e jour de la maladie, mais parfois qu'après le 28e jour chez les patients ayant des formes cliniques frustres) et se renforçant au cours de la convalescence.

"Un test sérologique positif ne doit pas changer votre comportement, vous pouvez encore contaminer une personne. "

Que disent-ils ? "Ils disent : vous avez été en contact avec le virus mais aujourd'hui on n'est pas en mesure de dire si ce contact avec le virus s'accompagne d'une protection donc si vous pouvez vous considérer protégé d'une réinfection. On ne sait pas si les anticorps que vous avez sont protecteurs" expliquait le Pr Arnaud Fontanet de l'Institut Pasteur, au printemps. Ce que confirmait Olivier Véran le 28 mai : " Un test sérologique positif ne doit pas changer votre comportement, vous pouvez encore contaminer une personne, la distanciation sociale s'applique à tous, que le test sérologique soit positif ou négatif. La sérologie ne remplace pas le test PCR".  

Qui est concerné ? Pour les tests sérologiques, la HAS recommande qu'il soit fait pour un(e) :

  • Diagnostic initial de patients symptomatiques sans signes de gravité suivis en ville, et de patients symptomatiques graves hospitalisés, en cas de discordance entre le tableau clinique et le résultat du test virologique (par RT-PCR) ;
  • Diagnostic de rattrapage de patients symptomatiques - graves et hospitalisés ou sans signe de gravité et suivis en ville - n'ayant pas pu faire l'objet d'un test virologique dans le délai de sept jours durant lequel il est sensible ;
  • Diagnostic étiologique à distance chez des patients symptomatiques sans signe de gravité diagnostiqués cliniquement mais n'ayant pas fait l'objet d'un test virologique ;
  • Détection d'anticorps chez les professionnels soignants et personnels d'hébergement collectif (EHPAD, prisons etc.) non symptomatiques, lors de dépistage et détection de personnes contact par amplification génique selon les recommandations en vigueur après un test virologique négatif et uniquement à titre individuel.

Test antigénique

test antigénique covid
Test antigénique © SYSPEO/SIPA

Les tests antigéniques sont autorisés en France dans le dépistage de l'infection Covid-19 depuis l'arrêté paru au Journal Officiel le 16 septembre. Il s'agit de tests rapides (résultats en 30 minutes) validés plus tôt que prévu pour "décharger les laboratoires de biologie médicale de certaines patientèles et améliorer les délais de transmission des résultats des tests RT-PCR" indique le texte. La Haute Autorité de Santé a donné son feu vert, le 25 septembre, à leur déploiement. Le 10 novembre, un communiqué du site Service-public.fr confirme leur disponibilité dans les pharmacies et les aéroports en France. Ils ne pouvaient jusqu'alors être pratiqués que par les médecins et les infirmiers diplômés d'État en cabinet ou au domicile du patient. Ces tests recherchent non pas le matériel génétique du virus, mais une protéine présente dans le virus. Ils répondent à la question "Le patient est-il oui ou non atteint du COVID-19 ?". La technique d'analyse est plus rapide et ne nécessite en général pas d'équipement spécifique. Le 30 novembre, la Haute Autorité de Santé se montre favorable à leur extension aux personnes contact détectées isolément ou au sein de clusters.

Test rapide : TDR, TROD

Quand on parle de dépistage rapide du Covid-19, il peut s'agir des tests sérologiques recherchant la présence d'anticorps au virus, dans le sang, en quelques minutes ou des tests antigéniques réalisés par PCR. Parmi ces tests rapides : des tests TDR (Test de Diagnostic Rapide), TROD (Test Rapide d'Orientation Diagnostique) et des autotests. "Ces tests ne permettent pas de statuer si la personne est contagieuse ou pas" rappelle la Haute Autorité de Santé (HAS) dans un Rapport d'évaluation du 14 mai 2020. Selon un arrêté du 11 juillet, les pharmaciens sont autorisés à réaliser des tests TROD. 

Autotests de dépistage du Covid-19

Les autotests de dépistage du coronavirus font partie des tests rapides, en quelques minutes. Le prélèvement, la lecture et l'interprétation des résultats sont réalisés par l'individu lui-même. Ils sont interdits en France.

Test salivaire

test salive cnrs coronavirus
Test salivaire de diagnostic du SARS-CoV-2 EasyCov avec un tube fermé de 0,5 mL contenant l’ensemble des réactifs nécessaires à une révélation de la présence du virus. © SkillCell

Dans un communiqué du 30 novembre, la Haute Autorité de Santé (HAS) annonce être favorable à l'utilisation et au remboursement de tests dits "RT-LAMP" réalisés sur prélèvement salivaire et nommé "EasyCovchez les patients symptomatiques pour lesquels le prélèvement nasopharyngé est impossible ou difficilement réalisable. "Même si ce test est moins performant que le test RT-PCR nasopharyngé - qui reste le test de référence - cette baisse de sensibilité et de spécificité est compensée par l'acceptabilité et la rapidité de réalisation, avec un résultat en 40 minutes contre plusieurs heures au minimum pour la RT-PCR" explique la HAS. La technique RT-LAMP sur laquelle est basée EasyCov permet d'amplifier l'ARN du virus (petite portion de son code génétique) puis de révéler ou non sa présence dans un échantillon salivaire. 

→ La "moins bonne spécificité" impose de réaliser un contrôle par un test RT-PCR sur prélèvement salivaire en cas de test positif. 

Quand se faire tester ?

Il faut se faire tester si on présente des symptômes évocateurs d'une infection Covid-19 ou si on est considéré comme un cas contact à risque. Depuis le 25 juillet, tous les Français qu'ils présentent ou non des symptômes évocateurs d'une infection Covid-19 peuvent se faire tester par PCR. Mais pour limiter les files d'attente, une priorisation des publics est mise en place depuis le mois de septembre. Sont prioritaires : 

  1. Les personnes avec ordonnance, présentant des symptômes de COVID-19 ;
  2. Les personnes ayant eu un contact à risque avec un cas confirmé, et ayant été contactées par la CPAM ou l'ARS dans le cadre du contact tracing (SMS ou mail de l'Assurance Maladie ou de l'ARS si cas contact à présenter)
  3. Les professionnels de santé et professionnels assimilés intervenant à domicile (carte CPS ou justificatif de travail à présenter).

→ "Il ne sert à rien de se tester trop souvent, rappelait le ministre de la Santé Olivier Véran, le 17 septembre. Le test doit être fait si vous avez un doute, si vous avez des symptômes et si le cas contact est avéré, si vous avez été appelé par l'Assurance maladie ou l'ARS." 

Cas contact

Si vous êtes "cas contact" d'une personne contaminée (qu'elle présente ou non des symptômes) : vous devez réaliser un test de dépistage (PCR) entre le 5e et le 7e jour après le dernier contact avec la personne malade si vous ne vivez pas avec elle (contact en entreprise, à l'école) ou 24 heures après si vous vivez dans le même foyer que la personne contaminée. Vous restez isolé en attendant les résultats. Si le test revient négatif, vous pouvez ressortir.

Test chez les enfants

Le dépistage du coronavirus chez l'enfant revêt les mêmes conditions que chez l'adulte. Il peut être réalisé lors de symptômes évocateurs du Covid-19 ou si l'enfant est "cas contact" d'une personne récemment diagnostiquée positive. Les parents doivent prendre rendez-vous dans un laboratoire pour faire réaliser le test à l'enfant. Le prélèvement doit être réalisé par une personne compétente pour ce type de prélèvement chez les enfants. Il s'agira comme pour les adultes d'un test PCR réalisé sous la forme d'un prélèvement nasal en quelques secondes. Un échantillon de mucus est prélevé dans le nez grâce à un long coton-tige, appelé écouvillon. Une fois récupéré, l'échantillon est analysé par le laboratoire. Les résultats sont généralement disponibles sous 48 heures. "Très peu de laboratoires acceptent de pratiquer le test sur les bébés, précise le Dr Sylvie Hubinois, médecin pédiatre, mais il est indispensable en cas de symptômes de maladie. Les tests salivaires instantanés se développent, nous espérons une disponibilité d'ici quelques mois". Ces tests seront plus faciles à réaliser sur les très jeunes enfants.

→ En attendant les résultats, l'enfant doit rester à la maison, il faut limiter ses contacts extérieurs et continuer d'appliquer les gestes barrières. 

→ En cas de positivité du test, il faut s'isoler 7 jours à la maison "Une enquête de cas contact sera lancée sur l'entourage familial, le personnel de la crèche, de l'école" explique la pédiatre. L'enfant ne peut plus aller à l'école avant le délai défini par son médecin. L'ensemble des membres du foyer sont testés pour évaluer l'étendue des transmissions intra-foyer. Les parents doivent prévenir sans délai l'école de leur enfant.

Où se faire dépister ?

Le dépistage du coronavirus peut se faire avec ou sans rendez-vous :

Il ne faut en aucun cas se rendre directement dans les laboratoires de biologie, mais les appeler au préalable.

  • Pour les patients diagnostiqués à l'hôpital ou hospitalisés avec signes de gravité, ces tests sont réalisés dans les hôpitaux. Depuis le 22 juillet, les aides-soignants, les secouristes et tous les étudiants en santé peuvent réaliser des tests Covid-19. 
  • Pour les patients ayant des symptômes du Covid-19 et une ordonnance médicale, il est possible d'être testé dans les laboratoires en ville. Il est aussi possible de se faire tester à domicile par des équipes médicales qui se déplaceront si le médecin le juge nécessaire. 
  • Pour les personnes ayant des symptômes du Covid-19, sans ordonnance, il est possible de recourir à un test antigénique en pharmacie depuis le mois de novembre.
  • Pour les personnes qui n'ont pas de symptômes et pas d'ordonnance, il est aussi possible d'être testé par RT-PCR dans les laboratoires en ville ou dans les centres de dépistages répartis un peu partout en France (mais elles ne sont pas prioritaires), et en pharmacie (il s'agira alors d'un test antigénique).
  • Depuis le 11 juillet, il est possible de réaliser un test sanguin rapide en pharmacie. 
  • Pour les personnes identifiées comme ayant été en contact, avec un risque élevé de transmission, avec une personne testée positivement, le test pourra se faire en laboratoire, sur présentation de l'ordonnance du médecin ou du SMS reçu de l'Assurance Maladie confirmant le statut de "cas contact à risque" et vous donnant ainsi priorité.  
  • A certains publics dans le cadre de campagnes spécifiques de dépistage : les personnes vulnérables, résidents de structures d'hébergement collectif et personnels exerçant dans ces structures en cas de premier cas confirmé au sein de la structure.

Comment trouver un laboratoire ?

La liste des centres de dépistages du Covid-19 est disponible sur Sante.fr ou sur le site du ministère de la Santé (cliquer sur "Sites de prélèvements"). Une fois que le lieu de dépistage est identifié, il faut appeler pour prendre rendez-vous. Si le laboratoire réalise le test sur place, il faut venir avec sa carte d'identité, Carte Vitale et l'ordonnance. Sans oublier de porter un  masque. Il faut aussi remplir un formulaire avant la venue en laboratoire afin de gagner du temps et faciliter votre passage. De retour à la maison, il faut rester isolé en attendant les résultats. 

Quelle est la durée du test ?

Le prélèvement par PCR, dans les narines, ne prend que quelques secondes.

Faut-il avoir une ordonnance ?

Depuis le 25 juillet, les tests PCR peuvent être réalisés sans ordonnance, que vous présentiez des symptômes ou non, y compris pour les personnes dites "cas contacts". Un test sérologique peut aussi être effectué sans ordonnance mais ne répondra alors à aucune indication médicale, sa signification ne sera pas explicitée par un médecin et il ne sera pas remboursé par la Sécurité sociale. Le test antigénique est aussi réalisé sans ordonnance.

→ Les personnes avec ordonnance sont prioritaires pour la réalisation du test.

Délai de résultats 

Le délai pour avoir un résultat de test PCR est entre trois et cinq heures au laboratoire. Le résultat de cet examen est normalement rendu au patient dans les 24 heures, et au médecin prescripteur, avec information à la cellule d'intervention de Santé Publique France en région, à l'Agence régionale de santé et au centre de crise de la Direction Générale de la Santé. Les tests antigéniques délivrent, eux, leurs résultats en 30 minutes.

Test positif : que faire après ?

test covid-19 positif ou négatif
Procédure de dépistage envisagée par le gouvernement à partir du 11 mai 2020. © Twitter Ministère de la Santé

Dès lors que la personne a été testée positive, les cas contacts les plus à risque doivent être testés et isoler pour casser la chaîne de transmission du virus. Depuis le 3 novembre : si vous êtes dépisté positif, vous recevrez un message sms de l'Assurance maladie renvoyant vers un site où vous êtes invité à préparer la liste de vos cas contact à risque ainsi que leurs coordonnées dans l'attente de l'appel téléphonique de l'Assurance maladie. Un isolement à domicile sera mis en place pour une durée de 7 jours. "Si vous partagez votre logement, restez dans une pièce spécifique en évitant les contacts avec les autres personnes du domicile, avait détaillé le ministre de la Santé, il ne faut pas toucher les objets touchés par les autres personnes, aérer votre domicile, porter en permanence un masque, les visites sont déconseillées, vous pourrez aller chercher des masques en pharmacie sans ordonnance." Si les symptômes s'aggravent, n'attendez pas, appelez le médecin ou le 15.

Test négatif

Même si le résultat du test est négatif, le patient ne doit avoir aucun contact avec des personnes fragiles pendant une semaine (personnes âgées de 65 ans et plus, porteuses d'une maladie chronique, avec obésité importante ou femme enceintes au 3e trimestre de grossesse). Il y aurait 20 à 30% de tests faussement négatifs c'est-à-dire une infection au COVID avec test nasopharyngé (PCR) négatif, quand le test est réalisé trop tôt ou trop tard. Il sort du domicile en portant systématiquement un masque. L'Assurance Maladie pourra lui adresser un arrêt de travail pour couvrir la période où il doit rester isoler. Les cas contacts négatifs au test peuvent retourner au travail sans délai.

Quel est le prix des tests ? Est-ce gratuit ?

Le coût du test de dépistage du coronavirus par PCR est de 54 euros. Depuis le 25 juillet, il est remboursé à 100% par l'Assurance Maladie, même sans ordonnance et sans avance de frais. Pour les tests sérologiques et rapides (antigéniques), les prix de référence fixés pour le remboursement de l'acte sont de 12,15 euros pour un test ELISA et de 9,45 euros pour un test de diagnostic rapide. Les tests antigéniques sont remboursés à 100% par l'Assurance maladie.

Faut-il faire un test avant un voyage ?

Selon les dernières mesures en vigueur actualisées par le site France Diplomatie, Il est actuellement obligatoire de présenter la preuve d'un test Covid-19 négatif réalisé moins de 72 heures avant le départ pour toute personne de 11 ans ou plus souhaitant venir en France et arrivant des pays suivants : Bahreïn, Émirats arabes unis, États-Unis, Panama, Afrique du Sud, Algérie, Chine, Équateur, Irak, Iran, Israël, Liban, Maroc, RDC, Turquie, Russie, Ukraine, Zimbabwé.

Pour les personnes arrivant d'un autre pays et âgés de 11 ans ou plus, il est fortement recommandé de présenter le résultat d'un test ou d'un examen biologique de dépistage virologique réalisé moins de 72 heures avant le départ ne concluant pas à une contamination par la COVID-19. Les personnes qui ne peuvent présenter un tel résultat sont dirigées à leur arrivée vers un poste de contrôle sanitaire permettant la réalisation d'un tel examen (test antigénique). Si le résultat est positif, les autorités peuvent imposer une période d'isolement de sept jours.

Pour voyager vers l'Outre-mer, quel que soit votre lieu de départ, chaque voyageur de plus de 11 ans doit produire le résultat de leur examen biologique de dépistage virologique réalisé dans les 72h précédant l'embarquement. Lors de votre arrivée en France métropolitaine depuis l'une de ces collectivités, vous serez encouragé à réaliser un test RT-PCR ou à défaut de respecter une période d'isolement de sept jours.

DATES CLES DU DEPISTAGE DU COVID-19 EN FRANCE
  • Janvier 2020 : "Les premiers tests ont été distribués fin janvier-début février 2020 aux hôpitaux" informait le Pr Arnaud Fontanet, membre du Comité scientifique Covid-19 le 20 avril 2020. Seuls les personnes présentant des symptômes d'atteintes respiratoires (toux, fièvre, essoufflement) et ayant eu un contact avec la Chine ou avec une personne revenant de Chine sont testés. 
  • 14 mars : la France passe au stade 3 de l'épidémie, seules les personnes à risque sont testées (soignants...).
  • 6 avril : Le dépistage prioritaire est étendu aux résidents des Ehpad et aux personnels qui les accompagnent.
  • 11 mai : lors du déconfinement, tous les Français qui présentent des symptômes évocateurs du Covid-19 peuvent se faire tester. 
  • 25 juillet : les tests peuvent être réalisés sans présenter de symptômes et sans ordonnance.
  • Septembre : face à l'afflux de patients, une priorisation des publics est instaurée pour la réalisation des tests. Les personnes avec ordonnance et symptômes sont prioritaires ainsi que les cas contacts "à risque".
  • Novembre : les tests rapides antigéniques sont déployés dans les pharmacies et aéroports en France pour renforcer et accélérer le dépistage des cas Covid-19.

Sources :

COVID-19 : les tests antigéniques sont performants chez les patients symptomatiques. Haute Autorité de Santé. Communiqué de presse. 25 septembre 2020.

• Avis n°8 du Conseil scientifique COVID-19 27 juillet 2020 Se préparer maintenant pour anticiper un retour du virus à l'automne. 27 juillet 2020.

Sérologie : les réponses à vos questions, 29 mai 2020.

Place des tests sérologiques rapides (TDR, TROD, autotests) dans la stratégie de prise en charge de la maladie COVID19. HAS. 14 mai 2020.

Avis du Conseil scientifique COVID-19 2 avril 2020 Etat des lieux du confinement et critères de sortie.

Publication de l'Institut Pasteur, résultats de tests sérologiques, 23 avril 2020.

Information du Gouvernement, Tests et dépistage, 10 mai 2020.

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