Une nouvelle bactérie à l'origine d'une infection cardiaque

Un homme de 55 ans a été admis à l'hôpital St Thomas de Londres après avoir présenté une inquiétante fièvre, des maux de tête, de dos, des vomissements et une perte de poids anormale. Grâce à des analyses de sang et des examens d'imagerie, les médecins ont pu lui diagnostiquer une infection cardiaque inhabituelle causée par une espèce inédite de bactérie cachée dans son aorte, l'artère qui amène le sang depuis le cœur vers tout le corps. Le sang oxygéné du cœur ne pouvait plus être correctement distribué. Cette étrange bactérie n'a pas pu être identifiée par les laboratoires d'analyse classiques. Les chercheurs ont dû utiliser un "séquenceur nanopore", un outil permettant d'analyser très rapidement l'ADN d'un germe. Les résultats ont montré que cette nouvelle souche faisait partie de la famille des Variovorax, un groupe de bactéries que l'on trouve généralement dans les sols et les eaux douces, mais jamais chez des humains. "Il s'agit du premier cas (et du seul connu pour le moment, ndlr) de ce Variovorax provoquant une pathologie humaine", écrivent-ils dans leurs travaux publiés le 21 janvier dans l'International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. A la demande du patient, cette nouvelle souche a été nommée Variovorax durovernensis, du nom latin de la ville d'où il est originaire, Canterbury.

Une rupture d'anévrisme quelques mois avant

Le patient étant un berger qui s'occupait de 60 moutons, les médecins suggèrent une contamination d'origine animale. "Une enquête plus approfondie a suggéré que le patient a été infecté pendant la saison de l'agnelage ou en donnant aux moutons des médicaments antiparasitaires, ce qui a été fait sans gants", explique Lara Payne, auteure principale de l'étude. Selon le rapport, l'homme souffrait d'une dermatite chronique, caractérisée par des irritations de la peau "qui servait probablement de porte d'entrée aux agents pathogènes environnementaux". Il avait fait quelques mois auparavant une rupture d'anévrisme, nécessitant la pose d'un stent et d'un traitement immunosuppresseur, ce qui le rendait plus vulnérable, selon les scientifiques. Les auteurs notent que les "infections atypiques" causées par des microbes environnementaux sont en augmentation, en particulier chez les patients sous traitement immunosuppresseur. "Être capable d'identifier facilement des espèces inhabituelles ou nouvelles de bactéries dans les laboratoires hospitaliers peut permettre d'identifier les infections plus rapidement et fournir aux patients des traitements plus ciblés", concluent-ils. L'homme a pu être traité avec des antibiotiques adaptés et être sorti d'affaires.